Toto je už tretie miesto, kde táto svätyňa stojí. Hovorí sa, že táto svätyňa sa pôvodne nachádzala na hore Jošino v provincii Jamato v stredo-západnom Japonsku. Svätyňa tu je umiestnená od roku 1648, predtým bola na mieste neďaleko odtiaľto, ale v období Tokugawa dostal zemepán Asakura, Chikugo no Kami to územie kde bola svätyňa od šógunátu, aby na ňom mal jednu zo svojich rezidencíí v meste Edo. Preto museli svätyňu opätovne premiestniť a premiestnili ju teda na toto miesto. V tejto džindže je umiestnený božský ochranca Šindžuku, božstvá v svätyni sú: Uga no Mitama no Kami, Yamato Takeru no Mikoto, Ukemochi no Kami. Už po mnohé storočia svätyňa slúži ako hlavný svätý ochranca oblasti Šindžuku.